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    先进通量 News Letter 第一期 [2009-04-01] 电子信息

    先进通量(上海)生物技术有限公司2010年2月5日 16:37 点击:1129

         
    第一期      
     2009.04.01
     
     
           Nature

    酵母菌株基因图谱助酿美酒

          英国研究人员成功绘制出几十种用于酿酒、制作面食和生物燃料的酵母菌株基因图谱。这一研究成果有望应用于酿酒等工业,?#37096;?#20026;人类基因图谱绘制提供借鉴。
          路透社 11 日报道,英国诺丁汉大学教授埃德·路易?#36141;退?#30340;同事以世界各地酵母菌株为研究对象,绘制出其中70多种的基因图谱。
          路易斯说,酿酒商可以据?#25628;?#21462;优质酵母菌株,酿造更多口味的啤酒和葡萄酒,延长酒开盖后的保质期。
          酵母基因与人体基因存在诸多类似之处,也?#34892;?#22810;变种,一直用于癌症、衰老?#22270;?#30149;研究。因此这一成果对人体基因研究具有参?#25216;?#20540;。路易斯说,研究人员可以根据酵母基因编制计算机软件,用于扫描更为复杂的人体基因。

    人类增强子组蛋白修饰反映全?#20013;?#32454;胞特异性基因表达

           Science
      

    罕见的基因变异可保护人们不患I型糖尿病

          据3月5日的《科学》杂志报?#28010;担?#30740;究人员已经发现了某一基因的四种变异体,这些变异体会保护人群中的一小部分不得I型糖尿病。
          Sergey Nejentsev及其在英国和美国的同僚比对了480名患有I型糖尿病的患者和480名没有该种疾病的人的DNA。他们对10种候选基因进行了测序,它们中有几个基因位于在?#26174;?#26102;所作的"整个基因组范围内相关研究中"所暗?#38236;?#19982;I型糖尿病有关的区域中。

    (这些研究所辨识的是染色体中的那些会使某人更容易罹患或更不容易罹患某一特定疾病的区域。) 下一步,研究人员在3万名受试者中的这些基因中寻?#19968;?#22240;的变异型以发现其与该疾病的相关性。他们在IFIH1 基因中发现了4种变异体,这些变异基因虽然罕见,但却?#23665;?#20302;罹患I型糖尿病的风险。令人?#34892;?#36259;的是,IFIH1基因与宿主对RNA病毒感?#38236;?#21453;应有关。
     

    RNAi在DNA甲基化缺陷选择性校正中的作用

           Cell

    发现负责脂肪转化基因

           美国研究人员在人体内发现一种负责将碳水化合物转化为脂?#38236;?#22522;因,这一发现有望帮助人?#24378;?#21046;体重。
          美国加州大学伯克利?#20013;?#30340;研究人员发现,一?#32622;?#20026; DNA - PK 的基因似乎可以控制肝脏将碳水化合物转化为脂?#38236;?#36807;程。在老鼠身上进行的实验表明,当这种基因被破坏后,不论喂给老鼠多少面包、通心粉等高碳水化合物食物,老鼠的体重?#30142;?#20250;有明显增加。

          研究人员之一罗杰 · 王说,实验表明,与正常老鼠相比, DNA - PK 基因遭到破坏的老鼠更?#29992;?#26465;且体内脂肪要少 40 %,这主要是因为碳水化合物无法转化成脂肪。
          研究人员认为,由于人类也有这一基因,在这一研究基础上未来有望研制出预防肥胖的药物,这样人们就可以放心享用美味的面包、通心粉和米饭等食物,而不用担心身材变胖。

           Nature Biotechnology

    安捷伦寡核苷酸序列合成技术助推高通量平行靶向测序

           美国麻省理工学院和哈佛大学 Broad 研究院的研究人员,利用安捷伦 (Agilent Technologies) 卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成大量生物素标记的RNA" 诱饵 " 用于靶向序列的捕获,成功应用于高通量平行靶向测序。
          研究人员从生物?#37202;?#25216;术得到灵感,随机选择了1,900个人类基因,针对这些基因的15,565个编码蛋白的外显子序列(﹥2.5 Mb)以及另外4个基因组大片段序列(﹥1.7 Mb),根据tiling方法设计并且利用安捷伦的"SurePrint"技术合成了22,000条200-mers寡核苷酸探针。再经PCR和反转录后得到足够量的生物素标记的RNA"诱饵",巧妙建立RNA-DNA的液相杂交?#20302;常?#23545;全基因组DNA中的目的序列进行成功捕获,序列数据经由Illumina公司的测序仪读取。
          测序结果表明:1)极佳的特异性;2)优秀的均一性;3)卓越的重?#20013;裕?)可以精确地检测SNP。
     

     
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